中医科成立于1987年，自建科以来秉承"大医精诚、勤求古训、博采众方"，中西医优势互补，采用"能中不西，先中后西，中西医结合"等原则治疗各类疾病。目前开设中医内科、中医妇科两个专科门诊和中医住院病区。中医科现有专业技术人员8人，主任医师2人，副主任医师2人，主治医师3人，住院医师研究生学历5名。浙江省基层名中医1人、苍南县名中医2人、省医坛新秀1人、市医坛新秀1人。